FCET数据处理是，利用“剥谱法” 对热中子俘获谱解谱，得到元素的相对产额。“剥谱法”解谱的回归模型认为，测量到的能谱信号是地层中各种元素标准谱的线性加权。在实验室条件下可测定各种元素的标准谱。通过最小二乘回归，可得到每种标准谱对总的测量信号的贡献，即元素的相对产额。
在获得元素相对产额后，根据“氧闭合模型”将其转化为元素浓度。“氧闭合模型”认为各种元素在地层中均以氧化物的形式存在，由元素的相对产额及元素与其氧化物的重量关系得到各种元素氧化物的相对比例，且各种氧化物的总和为100%。据此则可以得到各种元素在地层中的重量百分比。
最后利用Lithologic 模型，根据地层中的元素含量计算矿物含量。统计表明地层中Al 的含量与Si、Ca、Fe的含量之间具有良好的相关性，而Al的含量与粘土含量密切相关，因此，Lithologic 模型根据Si、Ca、Fe的含量估算Al 的含量及粘土含量；根据Ca的含量估碳酸盐的含量；根据S和Ca的含量估算蒸发岩的含量；QFM（石英+长石+云母的含量）=100- 粘土含量 - 碳酸盐的含量 -蒸发岩的含量。从而将元素的重量百分比转化为矿物的重量百分比。